1999年九月二十一日出生和2005年六月十六日出生的相差了2093天。因为1999年九月二十一日出生到2004年九月二十一日就是相差五年，那么一年是365天，五年就是1825天，在加上2004年九月二十一日到2005年六月十六日的268天总共就是2093天。所以说相差了2093天。